沉淀池池體平面為矩形，進口設在池長的一端，一般采用淹沒進水孔，水由進水渠通過均勻分布的進水孔流入池體，進水孔后設有擋板，使水流均勻地分布在整個池寬的橫斷面。沉淀池的出口設在池長的另一端，多采用溢流堰，以保證沉淀后的澄清水可沿池寬均勻地流入出水渠。堰前設浮渣槽和擋板以截留水面浮渣。水流部分是池的主體。池寬和池深要保證水流沿池的過水斷面布水均勻，依設計流速緩慢而穩定地流過。池的長寬比一般不小于4，池的有效水深一般不超過3米。污泥斗用來積聚沉淀下來的污泥，多設在池前部的池底以下，斗底有排泥管，定期排泥。

為避免短流，一是在設計中盡量采取一些措施（如采用適宜的進水分配裝置，以消除進口射流，使水流均勻分布在沉淀池的過水斷面上，降低紊流并防止污泥區附近的流速過大，采用指形出水槽以延長出流堰的長度；沉淀池加蓋或設置隔墻，以降低池水受風力和光照升溫的影響；高濃度水經過預沉，以減少進水懸浮固體濃度高產生的異重流等）；二是加強運行管理，在沉淀池投產前應嚴格檢查出水堰是否平直，發現問題，要及時修理。在運行中，浮渣可能堵塞部分溢流堰口，致使整個出流堰的單位長度溢流量不等而產生水流抽吸，操作人員應及時清理堰口上的浮渣；用塑料加工的鋸齒形三角堰因時間關系，可能發生變形，管理人員應及時維修或更換，以保證出流均勻，減少短流。通過采取上述措施，可使沉淀池的短流現象降低到小限度。

對于已經在斜板和斜管上生長的藻類，可用高壓力水沖洗，往往一經沖洗即可去除附著的藻類。活性污泥處理系統的二次沉淀池是該系統的重要組成部分。二次沉淀池的運轉是否正常，直接關系到處理系統的出水水質和回流污泥的濃度，對整個系統的凈化效果產生重大影響。二次沉淀池運行管理較為復雜，其運行過程中常見問題及防止措施參見“活性污泥法處理系統的運行管理”。